Por ejemplo, ahora Google va a ser capaz de ejecutar código de este tipo, llegando a páginas a las que antes no podía:

<div onclick="document.location.href='http://foo.com/'">
<tr onclick="myfunction('index.html')">
<a href="#" onclick="myfunction()">new page</a>
<a href="javascript:void(0)" onclick="window.open('welcome.html')">open new</a>

Es un tema a tener en cuenta y por si acaso conviene revisar los enlaces por Javascript que podamos tener para evitar sorpresas desagradables.

Más información:
JavaScript Links Now Passing PageRank & Anchor Text
New Advances In The Searchability of JavaScript and Flash, But Is It Enough?

1. Indexación de flash:
En general es dificil para Google y otros buscadores indexar contenido dentro de un flash, sin embargo, se sabe que ya es algo posible para Googlebot en cuanto a texto y links; en Abril de 2008 ellos mismos lo indicaron desde el Webmaster Central blog, donde también dicen que es algo en lo que siguen trabajando.

ACTUALIZACION: En marzo de 2009 se ha publicado un nuevo artículo en el blog oficial de Google comentando las ultimas mejoras que han aplicado a la indexación de flash: Mejorando la indexación de flash

2. Indexación de javascript:
Hace poco un usuario ha detectado a MSNbot en el proceso de crawling de URLs de su web site a las que solo se puede acceder ejecutando javascript. Googlebot tambien es capaz de ejecutar código javascript, aunque no de todo tipo; por mi experiencia personal puedo decir que no tiene problema para llegar a la URL de destino tras una redirección con location.replace.

3. Indexación de formularios:
De primeras se ve dificil que un bot pueda llegar a enviar un form para llegar a la página de destino, pero no es algo imposible y Google ya está experimentando con ello.

4. Indexación de iframes:
Ya hace un tiempo que los buscadores no tienen problema para indexar iframes, aunque siempre teniendo en cuenta que no son adecuados para SEO y conviene evitarlos. Como nota, indicar que Googlebot no tiene problemas en llegar a una página a traves del link de la etiqueta iframe, aunque esa página de destino tenga la meta etiqueta noindex en la cabecera.